Идентификация фитокомпонентов из Houttuynia cordataThunb. как потенциальные ингибиторы белков репликации SARS-CoV-2 с помощью ГХ-МС/ЖХ-МС-характеристик, молекулярного докинга и молекулярно-динамического моделирования

Пандемия COVID-19, вызванная коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2), является массовым вирусным заболеванием.
вспышка заболевания, имеющая международное значение. Основной целью настоящего исследования является выявление биологически активных фитокомпонентов
из традиционного противовирусного растения Houttuynia cordata Thunb. как потенциальные ингибиторы трех основных белков репликации SARSCoV-.
2, а именно: основная протеаза (Mpro), папаин-подобная протеаза (PLpro) и рибоза-фосфатаза ADP (ADRP), которые контролируют
процесс репликации. Из H. cordata с помощью ГХ-МС/ЖХ-МС и ГХ-МС было выделено 177 фитосоединений.
Они были докированы против трех белков (рецепторов) SARS-CoV-2 — Mpro, PLpro и ADRP с помощью программ Epic, LigPrep и
Скользящий модуль сюиты Шредингера 2020-3. В ходе докинг-исследований фитосоединения (лиганд) 6-гидроксиондансетрон (A104)
продемонстрировали сильное сродство к рецепторам Mpro (PDB ID 6LU7) и PLpro (PDB ID 7JRN) с G-score
— 7,274 и — 5,672, соответственно, в то время как кверцитрин (A166) также показал сильное связывающее сродство с ADRP (PDB ID
6W02) с G-score -6.788. Молекулярно-динамическое моделирование (МДС) выполнено с помощью модуля Desmond пакета Schrödinger
2020-3 продемонстрировал лучшую стабильность в лиганд-рецепторных комплексах A104-6LU7 и A166-6W02 в течение 100 нс, чем
комплекс A104-7JRN. Исследование ADME-Tox, проведенное с использованием SwissADMEserver для изучения фармакокинетики выбранных препаратов
Фитосоединения 6-гидроксиондансетрон (А104) и кверцитрин (А166) показали, что 6-гидроксиондансетрон проходит
все необходимые правила поиска лекарственных средств, которые потенциально могут ингибировать Mpro и PLpro SARS-CoV-2, не вызывая токсичности
В то время как кверцитрин продемонстрировал менее выраженные лекарственные свойства, но также проявил себя как потенциальный ингибитор ADRP. Присутствует
Полученные результаты открывают возможности для разработки 6-гидроксиондансетрона и кверцитрина в качестве нового терапевтического препарата против
КОВИД-19